近年來,隨著測序技術的高速發展以及國家一系列利好政策的推動,以血漿中的游離DNA(cell free DNA,cfDNA)為研究對象的無創產前診斷和腫瘤液體活檢產業蓬勃發展。由于血漿內胎兒DNA和循環腫瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)含量較低,低頻突變或超低頻突變的檢測仍困難重重。
在母親血漿中,單胎妊娠早期的胎兒釋放的游離cfDNA濃度小于10%(1)。隨著保存時間的延長,白細胞降解及隨之而來的母體基因組DNA(gDNA)的釋放將嚴重影響低含量的胎兒DNA的比例及完整性。對于循環腫瘤DNA而言,這一問題更為突出。在癌癥早期,突變等位基因的頻率(mutant allele frequencies,MAFs)可能低至1/10,000(2)。cfDNA樣本本身在保存過程中如果被“背景”gDNA干擾,會造成檢測靈敏度的大幅度降低以及大量數據的浪費。因此如何穩定血漿中的白細胞,降低其在保存過程中因降解而釋放大量gDNA造成的“污染”,是液體活檢的重要一環。
對于cfDNA的保存,利用超高速離心分離血漿是最直接有效的避免白細胞gDNA干擾的方法。但是實際樣品采集中,往往不具備高速離心和冷凍保存的條件。游離核酸采血管便在這種情況下應運而生。這些保存管的目的就是盡可能長時間的在常溫狀態下保存血漿中的游離核酸。目前商業化的游離核酸采血管,有些利用甲醛等交聯劑穩定白細胞減緩背景gDNA的釋放。但是這些交聯劑會損傷cfDNA,并且會降低測序檢出率。
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